Amasya ilinin en küçük ve ekonomik yönden en az gelişmiş ilçesidir. Türkiye de  sadece illere özel bir konuma sahip olan, dört tane ilin ortasında bulunmasıdır ilçe Çekerek Irmağı Vadisinde ve Amasya ilinin Güneybatısı yönünde kurulmuş olup Doğuda Tokat ‘ın Zile İlçesi, Batıda Çorumun Orta köy  ilçesi, Kuzeyde Amasya merkez, Güneyde Yozgat ‘ın  Aydıncık  ilçesiyle sınırlıdır.

            Yazları sıcak ve kurak, kışları ılık ve yağışlı geçmek de  olup, kışları fazla sert geçmemektedir. İlçe bozkırlarla ve fundalıklarla kaplıdır. Yer yer bataklık , orman ve korulara rastlanmaktadır. Yeryüzü  şekli oldukça engebeli ve dağlıktır. İlçenin batısında  Karadağ, güney ve doğusunda Tekke dağı bulunmaktadır. En önemli akarsuyu  Yeşilırmağın kolu olan Çekerek ırmağı ve Çorum ırmağıdır.